一、分析背景蛋白一般由一个或多个功能域所组成，在不同蛋白质组合中出现的不同结构域导致了自然界中蛋白质复杂的多样性。鉴定一个蛋白中的结构域有助于更深入地理解蛋白功能。Pfam是一个大型蛋白结构域家族的数据库，每个蛋白家族都由多个序列比对和HMMs（hidden Markovmodels，隐马尔可夫模型）所体现。最新版本为27.0（2013年3月，包含14831个蛋白家族）Pfam包括两个质量级别的家... 阅 读 全 部 >
数据，已经渗透到当今各行各业和业务职能领域。但如何处理已获得的复杂数据并从中挖掘出有效的信息成为了大家关注的问题。其中数据可视化是极其重要的一个方面，因为 无论如何对数据进行分析处理，能够简明准确的展示最终结果，才是数据可视化的点睛之笔。在前几期的介绍中，王老师带领大家一起盘了许多FlowJo®插件，也针对数据分析软件的实际应用进行了分析， 那么本期，王老师将继续从生物学角度，带大家了解数... 阅 读 全 部 >
前言条形图专用于离散变量和数值变量之间的可视化展现，其通过柱子的高低，直观地比较离散变量各水平之间的差异，它被广泛地应用于工业界和学术界。在R语言的ggplot2包中，读者可以借助于geom_bar函数轻松地绘制条形图。对于条形图大家对其的印象是什么呢？又见过哪些种类的条形图呢？在本篇文章我将带着各位网友说道说道有关条形图的哪些品种。ggplot2的语法讲解如果读者对...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
作者：路遥马亡R语言中文社区专栏作者知乎ID：https://zhuanlan.zhihu.com/c_13540979700布局参数先介绍一个布局参数：#par(mfrow=c(a,b)) #表示在PLOTS区域显示a行b列张图 par(mfrow=c(3,1)) x <- rnorm(100) y <- rnorm(100) plot(x, y, xlim=c(-5,5),...阅... 阅 读 全 部 >
在前面的推文中，我给大家介绍了绘制条形图时常见的几种误区，以及如何避免误区，以提升条形图“逼格”的方法，权当抛砖引玉了。上期推文链接：今天将给大家继续介绍条形图，希望大家能够通过我的介绍，获得一些启发。条形图最常规的用途是展示变量的频数分布。条形图虽然看着呆板，但它也有几个“兄弟姐妹”，即我们可以使用其他形式的图形来展示条形图中相同的信息！这句话说起来很简单，但是在实际操作过程中，大家还是需要根据... 阅 读 全 部 >
2021年第39周。这一周R语言学习，记录如下。01Modern Statistics with R 一本在线开放书籍，介绍R语言做数据整理和探索，以及推断和预测的工作。访问网址：http://www.modernstatisticswithr.com/02R4DS书籍最近，我在重温R4DS这本书籍。你所想的数据科学是什么？实际...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
taoyan：伪码农，R语言爱好者，爱开源。个人博客: https://ytlogos.github.io/公众号：生信大课堂绘制带有误差棒的条形图library(ggplot2)#创建数据集df <- data.frame(treatment = factor(c(1, 1, 1, 2, 2, 2, 3, 3, 3)),response = c(2, 5, 4, 6, 9, 7, 3, 5... 阅 读 全 部 >
真不想要ggplot2的默认配色，毫无美感呐~可以自己设置的呀！详细教程奉上，拿走不谢哟~ggplot2是R语言中常用的包，它具有强大的绘图功能，在生物学数据可视化过程中，有很多图都是用ggplot2画出来的。但是有时候我们并不想要ggplot2的默认配色，如何修改呢？下面我们来告诉大家，如何在ggplot2中设置自己想要的颜色！一步一步往下看好看就右下边给我一朵小花花示例数据：...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
冲击图(alluvial diagram)是流程图(flow diagram)的一种，最初开发用于代表网络结构的时间变化。实例1. neuroscience coalesced from other related disciplines to form its own field. From PLoS ONE 5(1): e8694 (2010)实例2. Science...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
作者：邬书豪，车联网数据挖掘工程师 ，R语言中文社区专栏作者，R语言中文社区负责人之一。微信ID：wsh137552775知乎专栏：https://www.zhihu.com/people/wu-shu-hao-67/activities第一篇请戳：kaggle：R可视化分析金拱门餐厅食物营养性（一）公众号后台回复“金拱门”下载数据集。#比较不同的脂肪率（类别=牛肉和猪肉 & 鸡...阅读... 阅 读 全 部 >