作者：张丹，R语言中文社区专栏特邀作者，《R的极客理想》系列图书作者，民生银行大数据中心数据分析师，前况客创始人兼CTO。个人博客 http://fens.me， Alexa全球排名70k。前言作为数据分析师，每天都有大量的数据需要处理，我们会根据业务的要求做各种复杂的报表，包括了分组、排序、过滤、转置、差分、填充、移动、合并、分裂、分布、去重、找重、填充 等等的操作。有时为了计算一个业...阅读... 阅 读 全 部 >
派森诺转录组致力于科技服务的产品丰富且专业，产品在丰富的同时也有细致划分。今天带大家来了解一下对于无参考基因组的物种，比较转录组和无参转录组的区别。区别：1、分析目的不同：无参转录组测序：利用高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。根据将不同组的unigene进行比较，得到差异基因进行分析。比较转录组测序：是基于高通...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
植物方面的基因家族文章非常之多，动物方面又以鱼类等海洋生物文章居多，其实我们常见的陆地动物同样可以发基因家族SCI文章。这边给大家介绍一篇由中国农业科学院兰州畜牧医药研究所于2022年1月21日发表的SCI文章，文章对牦牛中角蛋白基因(KRTs)家族进行鉴定与分析。下面跟随小编一起来了解陆生动物基因家族分析都做哪些研究吧！标&nb...阅读全文... 阅 读 全 部 >
转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台10余年前，华盛顿大学的生物学教授Michael Skinner的团队做过一系列有意思的实验。2005年，他们将怀孕的女大鼠（F0）暴露于一种农业中常用的杀真菌剂，乙烯菌核利。接着在无杀菌剂的环境中将她们的后代拉扯大，一直养了4代，也就是养到了她们的玄孙（F4）。结果几乎所有玄孙子的精子数量、繁殖能力都有下降，并且出现了年龄相关的不育症。在所...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
本文根据 2016 年 8 月清华大学颉伟研究员在复旦大学「表观基因组学暑期国际讲习班」中的报告整理而成，本文采用第一人称叙述，文中的“我”皆指颉伟研究员。报告原视频详见：系列视频5 | 清华颉伟：表观遗传的遗传与重编程，视频全长约 2h30min，文字约 2 万字（不含提问）。且听颉伟教授由浅入深，娓娓道来。本文正确打开方式：阅读 2 万字长文确实需要花点时间，不过本文语言通俗，逻辑严密...阅... 阅 读 全 部 >
发现与细胞状态相关的基因表达特征是分子生物学研究的重要方向。对于细胞在分子层面的差异，可能表现为跨多个维度，如基因组变异、基因表达、蛋白质翻译和翻译后修饰（PTM）。这些不同维度之间的变化是动态的，单独分析某特定维度可能会丢失很多信息，这就需要对这类多层信息进行综合分析，以了解生物系统各个组成部分之间的相互作用。近年来，高通量RNA测序和质谱技术在转录和蛋白质方面的最新进展使其成为...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2019年2月26日，中国科学院植物研究所北方资源植物重点实验室与北京百迈客生物科技有限公司等单位合作，成果以“A Chromosome-Scale Genome Assembly of Paper Mulberry (Broussonetia papyrifera) Reveals the Genetic Basis of Its Forage and Papermaking Usage”为题发... 阅 读 全 部 >
ATAC-Seq （Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing）作为表观遗传学研究技术大家庭中的重要成员，已经在越来越多的研究中得以应用。其技术原理见：https://mp.weixin.qq.com/s/fVXgsHm8FNtkJFTFZuIQZQ。今天，我们来带大家看...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
经典的遗传学（Genetics）无法解释同卵双胞胎为何长相并非一模一样，克隆三花猫为何毛色不一致，因为这些变化不是由核酸序列改变引起的，而是与我们今天要介绍的表观遗传有关。表观遗传（Epigenetics）是指，在核酸序列不发生改变的情况下，遗传物质出现了可遗传的变化，从而导致可遗传的表型改变。目前，表观遗传学已从一个少有人关注的领域变成如今的研究热点。表观遗传现象表观遗传的现象很多，已...阅读... 阅 读 全 部 >
表观遗传学作为近10年来炙手可热的方向，其研究已经深入到各个学科和领域，促进了医学，动物学，植物学，生殖发育等学科的发展，在疾病机制，诊断治疗，动植物性状改良等方面均获得了令人瞩目的成就和显著的突破。虽然全世界表观遗传学研究的如火如荼。但是，很多实验室仍不清楚表观遗传学到底是神马东西？总是听到很多老师和我们咨询，希望自己的课题能向前沿的方向靠拢，但总感觉隔着一层纱，感觉有些“高大上”，虽然很多文章... 阅 读 全 部 >