当我开始使用R时，像任何初学者一样，我想要一个真正能够工作的代码和一个最低限度可理解的图像，并且很长一段时间这是我的主要目标，但是一旦这一点完成后，我意识到我的可视化看起来很糟糕，特别是在比较和审查其他博客和网站之后，我开始搜索如何改进我的可视化。下面，创建一个简单且专业的图像的一些技巧，以吸引读者的注意力。01 创建可视化让我们开始一个简单的可视化，来自diamonds数据集的直方图。1.1 包... 阅 读 全 部 >
关于图表的组合排版，在之前的微信文章中介绍过很多常规的方法，比如《绘制复杂组合图表的独家秘笈分享》 、《如何用Graphpad Prism绘制超复杂组合图？》 、《如何用Origin完成图表排版？》 等。可是，有小伙伴就问了，正如小项羽所言，“剑一人敌，不足学，学万人敌”，那么有没有批量自动化拼图的方法？ 既然是批处理，就免不了需要写脚本，这里推荐两个专职拼图的R包：cowplot和patchwo... 阅 读 全 部 >
1 如何把多个图组合成一幅图？数据科学的生命周期离不开分析/研究结果的交流。事实上，数据可视化是R作为一种数据科学语言相对于最著名的Python具有优势的领域之一。由于ggplot2是R程序员的可视化DSL(领域特定语言)，现在的竞争变成了如何有效地使用ggplot2包在给定的位置显示可视化。在本教程中，我们将学习如何组合多个ggplot图来生成可公开的图。我们将要使用的R包是cowpl...阅读... 阅 读 全 部 >
R语言基本绘图函数中可以利用par()以及layout()来进行图形排列，但是这两个函数对于ggplot图则不太适用，本文主要讲解如何对多ggplot图形多页面进行排列。主要讲解如何利用包gridExtra、cowplot以及ggpubr中的函数进行图形排列。绘制图形 #load packages library(gridExtra) library(cowplot) libr...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
什么类型的可视化用于什么类型的问题？本文可帮助您为特定分析目标选择正确的图表类型，以及如何使用ggplot2在R中实现它。一个有效的图标:在不歪曲事实的情况下传达正确的信息简单而优雅的表达信息内容通过美学表达信息，而不是掩盖信息没有信息负载下面介绍了八类常见的图表可视化情景。在绘图之前，请仔细考虑你准备如何通过可视化的方式...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
本文为雷锋网字幕组编译的技术博客 Happiness 2017，作者为 Javad Zabihi。翻译 | Binpluto 整理 | 孔令双雷锋网 AI 研习社：我们选择了 2017 幸福度数集，一个来自 Kaggle 平台的数集。这份数集给出了来自世界 155 个国家，关于包括家庭状况，平均寿命，经济水平，宽容度，对政府的信任感，自由度和反乌托邦残留在内的...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
主成分分析（PCA），是考察多个变量间相关性的一种多元统计方法，研究如何通过少数几个主成分来揭示多个变量间的内部结构，即从原始变量中导出少数几个主成分，使它们尽可能多地保留原始变量的信息，且彼此间互不相关。图1 主成分分析得分图在生物医学领域，生物样本存在于一个复杂的系统，容易受各种环境因素及自身基因、代谢等因素的影响，变量非常多。PCA可以从复杂的数据中找到最主要的元素，去除...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
RNA长度分布图是描述小RNA测序结果概述的重要部分，我们以文献“Characterization of mouse serum exosomal small RNA content: The origins and their roles in modulating inflammatory response”为例，绘制RNA长度分布条形图。1 准备数据准备数据需要包括...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
识图：先理解 每个点是什么 （点代表基因、样品、通路或其它的，这个认识可以来自于常识，来自于自己对数据的认识，或来自于文章作者的描述），然后看 横轴代表什么 、 纵轴代表什么 ，再看图例中展示的其他信息如颜色、大小和形状分别代表什么。这些都理顺了，图理解就不难了。来源：https://www.r-graph-gallery.com/272-basic-scatterpl...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
什么是火山图？火山图（Volcano plot）——顾名思义，因其绘制后图形的效果酷似火山而命名。用于显著差异基因表达的展示，包含显著和差异两个重要信息。显著性一般用T-Test的P值衡量，差异性常用Fold Change值作为筛选标准。如何看懂火山图？每个人在使用火山图时的需要可能不一样，绘制出来的效果就不一样。小编汇总了部分火山图的展示效果，给大家一些参考~看到这些火山图，...阅读全文>... 阅 读 全 部 >