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2022
10-03

科研绘图-配色指南

好的图形展示方式能够简明扼要地表达数据，而好的配色一方面能够突出数据的重点，另一方面能够使所有的数据和谐共存。好的配色是图的二次进化，能够赋予图片“生命”。1，日常生活中使用的颜色日常生活中，我们经常提到各种颜色，例如赤橙黄绿青蓝紫，中国红，香蕉黄等，一般用来定性描述物体的颜色属性，不够精确，例如，红色，是红绿灯的红色，还是苹果的红色？所以一般不在科技论文中使用。2，RGB配色方案最常用的颜色方案... 阅 读 全 部 >
2022
10-01

干货|原来用GEO数据挖掘还可以这样完整复现一篇SCI

你还在为找不到课题方案而焦虑吗，复现一篇论文吧！你还在为找不到研究思路而苦恼吗，复现一篇论文吧！你还在为找不到数据方法而悔恨吗，复现一篇论文吧！复现？怎么复现？先来看一下某乎上的回答。有道理有道理，感觉也不是很难的样子对不对，聪明的智商又重新占领高地了，此刻我就是华佗再世扁鹊附体，复现没在怕的，摩拳擦掌，跃跃欲试，开整！结果一顿操作猛如虎，代码也写了，夜也熬了，怎么和我想象中的不一样！！！e...... 阅 读 全 部 >
2022
10-01

宝藏综述丨详解溶酶体在生理活动、疾病和治疗中的作用

撰写：橘子 来源：小张聊科研平台的“ i生信”公众号，微信公众号搜索“ i生信”即可关注/扫描关注见文末大家好！今天我们来介绍一篇关于溶酶体的综述，该文章发表在Journal of Hematology& Oncology，题目为“Role of lysosomes in physiological activities, diseases, and thera...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
09-30

科研小萌新，掌握这些技巧，轻松玩转各个基因！

科研的基本研究便是基因的研究，拿到一个新基因，第一步要做的便是查阅文献、数据库，用一切方法来确定基因是否值得研究。下面我就介绍几个常用网站，以模式动物小鼠基因MMP2为例，对基因进行初步分析。一：基因基本信息1.首先通过biogps网站(http://biogps.org/#goto=welcome)看一下基因的组织表达。(1)输入基因名称，选择物种，这样就可以看到该基因在各个组织的表达...阅读... 阅 读 全 部 >
2022
07-08

科研巨佬的“万水千山图”是如何绘制的？

最近，在文献中看到这样一个令人惊艳不已的组合图，如下。很明显，这个图至少是由8个小图表组合而成的，通过坐标轴粗细和图表间隔的不一致可以看出来。可见，熟练使用Ai(Adobe illustrator)也是成为科研巨佬的必备技能。(The Plant Cell, 2020)除去两侧的聚类树和条形图，组合图的中间部分其实是一种比较新颖的山峦图，也称作山脊线图(Ridgeline plots)，可以用作图... 阅 读 全 部 >
2022
06-02

收藏| Primer-BLAST：NCBI的引物设计和特异性检验工具

一、Primer-BLAST 介绍Primer-BLAST，在线设计用于聚合酶链反应（PCR）的特异性寡核苷酸引物。Primer-Blast 可以直接从 Blast 主页（ http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ ）找到， 或是直接用下面的链接进入：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/这个工具整合了目前流行的 P...... 阅 读 全 部 >
2022
05-10

想用Linux做生信数据分析，不会安装怎么办？

Linux系统是生物信息分析中需要用到的系统，我们可以在服务器上或者个人电脑上安装Linux系统，从而使用生物信息软件进行生物信息数据分析，下面我们一步步的开始进行Linux系统的安装。安装步骤：准备一个U盘，电脑插上U盘，打开UltraISO软件，文件---打开，选择你下载好的CentOS-6.5-x86_64-bin-DVD1文件，点启动光盘--写入硬盘镜像，在硬盘驱动器里面选择你的...阅读... 阅 读 全 部 >
2022
05-02

分析数据时你可能遇到一些奇奇怪怪的符号……

在分析数据的时候，不管是数据表格中还是脚本中经常会出现一些奇奇怪怪的符号。这些符号中有些符号用法简单，而另一些符号功能特别强大。下面就以R语言为例，为大家整理一下常见符号的功能用法。NaN“Not a Number”的缩写，非数值，NaN参与运算时返回NaN。a <- 0/0a#[1] NaNa+1#[1] NaNNA“Not available”的缩写...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2021
12-12

中国学者2天连发9篇NAR，全部为医学数据库方向

Nucleic Acids Research/核酸研究，IF17分，在生物医学大数据领域一直都是投稿人心中的“圣洁女神”，发表在该刊上的文章同行认可度高、行业影响力大。随着医疗大数据时代的来临，越来越多的高质量临床数据被整理收集，形成了一套完整的数据库。近期我们发现，中国学者在NAR上接连发表了9篇生物医学数据库（database）的原创研究。 这些公共数据促进了临床数据和科研...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
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