2022 07-08 科研巨佬的“万水千山图”是如何绘制的? 最近,在文献中看到这样一个令人惊艳不已的组合图,如下。很明显,这个图至少是由8个小图表组合而成的,通过坐标轴粗细和图表间隔的不一致可以看出来。可见,熟练使用Ai(Adobe illustrator)也是成为科研巨佬的必备技能。(The Plant Cell, 2020)除去两侧的聚类树和条形图,组合图的中间部分其实是一种比较新颖的山峦图,也称作山脊线图(Ridgeline plots),可以用作图... 阅 读 全 部 >
2022 06-02 收藏| Primer-BLAST:NCBI的引物设计和特异性检验工具 一、Primer-BLAST 介绍Primer-BLAST,在线设计用于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。Primer-Blast 可以直接从 Blast 主页( http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ )找到, 或是直接用下面的链接进入:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/这个工具整合了目前流行的 P...... 阅 读 全 部 >
2022 05-10 想用Linux做生信数据分析,不会安装怎么办? Linux系统是生物信息分析中需要用到的系统,我们可以在服务器上或者个人电脑上安装Linux系统,从而使用生物信息软件进行生物信息数据分析,下面我们一步步的开始进行Linux系统的安装。安装步骤:准备一个U盘,电脑插上U盘,打开UltraISO软件,文件---打开,选择你下载好的CentOS-6.5-x86_64-bin-DVD1文件,点启动光盘--写入硬盘镜像,在硬盘驱动器里面选择你的...阅读... 阅 读 全 部 >
2022 05-02 分析数据时你可能遇到一些奇奇怪怪的符号…… 在分析数据的时候,不管是数据表格中还是脚本中经常会出现一些奇奇怪怪的符号。这些符号中有些符号用法简单,而另一些符号功能特别强大。下面就以R语言为例,为大家整理一下常见符号的功能用法。NaN“Not a Number”的缩写,非数值,NaN参与运算时返回NaN。a <- 0/0a#[1] NaNa+1#[1] NaNNA“Not available”的缩写...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2021 12-12 中国学者2天连发9篇NAR,全部为医学数据库方向 Nucleic Acids Research/核酸研究,IF17分,在生物医学大数据领域一直都是投稿人心中的“圣洁女神”,发表在该刊上的文章同行认可度高、行业影响力大。随着医疗大数据时代的来临,越来越多的高质量临床数据被整理收集,形成了一套完整的数据库。近期我们发现,中国学者在NAR上接连发表了9篇生物医学数据库(database)的原创研究。 这些公共数据促进了临床数据和科研...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2021 08-25 研究微生物的你,这些数据库怎能不知道? 微生物的基因组序列被研究的越来越多,当我们得到菌株的基因组序列后,我们该怎样进行分析研究?通常我们会通过NCBI、KEGG等公共数据库来进行基因组的注释分析,但有时你会发现分析结果没有针对性,想要研究却无从下手。这时我们不妨换个专有数据库来试试,或许能得到不一样的结果,从而踏上“不一样”的科研之路,发更高分的文章。下面就让小编来介绍几个微生物专有数据库供大家参考。Isfinder (the ref... 阅 读 全 部 >
2021 08-20 多快好省的宏基因组研究技巧——资深专家分享 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体,而大量复杂的微生物群体存在培养困难,构成复杂(包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物)。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成,基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术的发展,让我们可以不经过培养,一次性了解微生物群落构成甚至基因代谢组成。随着技术的进步,检测方法也逐渐丰富,对应的分析...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2021 08-15 研究思路|微生物组+代谢组多组学应用案例解读 案例在手,思路不愁!今天继续为大家分享几篇微生物组+代谢组多组学应用在肠道样本中的文献案例。案例1:原名:Microbiome-metabolome reveals the contribution of gut-kidney axis on kidney disease译名:微生物-代谢组学揭示了肠道-肾轴对肾脏疾病的贡献期刊:Journal of Translational M...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2021 05-11 科研干货:8个英文论文查重网站,你值得收藏 为满足大家对于论文检测需求,小编特推荐以下几个英文论文查重网站,在这先提醒一下,中文论文的英文摘要部分也可以试着检测,请伙伴们收藏好!1 TurnitinTurnitin是世界上主流的学术不端检测系统之一,其研发公司iParadigms专注于文稿的原创性检测及电子评估系统的开发。Turnitin系统与国际著名出版商(收录80%以上的SCI期刊)指定使用的CrossChec...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2020 12-15 科研人必须要知道的那些投稿选刊神器 本文首发于“百味科研芝士”微信公众号,转载请注明:百味科研芝士,Focus科研人的百味需求。之前我们跟大家说过cover letter和response letter怎么写,其实中间还漏了极其重要的一环,那就是选择合适的SCI投稿期刊。投稿和相亲有点类似,比如人家是个淡泊名利的大颜控,你长得丑即使腰缠万贯也是白搭,浪费时间还消耗感情。所以说,“有的放矢高度匹配,...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >