2023
05-14
05-14
选好基因，单基因泛癌发7分+也不难！
作者：作图丫导语GUIDE ╲CDCA4（细胞分裂周期相关蛋白4）参与细胞周期调节，是癌症的潜在的生物标志物。背景介绍2022年啦，单基因泛癌生信还可以发高分吗？当然是可以的！今天小编给大家带来一篇刚刚发 表在Front Immunol（IF=7.6）的单基因泛癌文章，本文的所有生信分析部分基本都是使用数据库或者web工具完成的，很有借鉴意义。 题目为 ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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作者：作图丫导语GUIDE ╲CDCA4（细胞分裂周期相关蛋白4）参与细胞周期调节，是癌症的潜在的生物标志物。背景介绍2022年啦，单基因泛癌生信还可以发高分吗？当然是可以的！今天小编给大家带来一篇刚刚发 表在Front Immunol（IF=7.6）的单基因泛癌文章，本文的所有生信分析部分基本都是使用数据库或者web工具完成的，很有借鉴意义。 题目为 ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
05-14
05-14
单基因泛癌+实验验证，就能发表8分+
导语AHSA1是Hsp90的ATP酶的主要激活剂，然而，AHSA1在肿瘤细胞中的作用仍然未知。背景介绍今天小编为大家带来一篇单基因泛癌生信分析+简单实验验证就发表了8分+期刊的案例。文章于今年六月刚刚发表在Front. Immunol 上， 题目为The Prognostic and Immunotherapeutic Significance of AHSA1 in Pan-Cancer, ..... 阅 读 全 部 >
2023
05-14
05-14
4+无代码纯生信：基因家族套路解析
2021年新的开始，现在还能靠纯网页分析发高分生信吗？答案是：YES！今天给大家介绍的是去年9月份发表在 frontiers in Oncology (IF=4.848)的一篇文章，主要内容是基因家族chromobox在结直肠癌中的预后价值及免疫浸润的综合分析。 这篇文章里运用到网页工具如下：Oncomine、Gene Expression Profiling Interactive Analy... 阅 读 全 部 >
2023
05-14
05-14
这篇最新二区7分 +SCI太牛了！平平无奇，零代码就能搞定？到底好在哪里 ？
今天给大家带来的复现比较经典文章是来自2区的Frontiers in Immunology杂志，影响因子高达7.5分！题目是： Hepcidin Upregulationin Lung Cancer: A Potential Therapeutic Target Associated With Immune Infiltration要素拆解题目：肺癌中铁调素升高可以作为潜在的免疫相关的治疗靶标 疾... 阅 读 全 部 >
2023
05-13
05-13
红花光调控信号途径关键基因CtHY5的克隆及表达分析
转录因子HY5（ELONGATED HYPOCOTYL5）是基本亮氨酸拉链类（basic leucine zipper，bZIP）转录因子类的转录因子，最早是在拟南芥中克隆得到[1]。HY5编码的蛋白为光敏色素下游的核心光信号调节因子，在光信号通路中具有十分重要的作用，HY5的C末端具有特殊的bZIP结构域，能够直接与基因启动子作用元件G-box（CACGTG）相结合，从而能调控基因的表达它能通过... 阅 读 全 部 >
2023
05-13
05-13
怎么把生信SCI做出创新性？这八个数据库让我长见识了！（文末彩蛋！）
从小白的角度，一刻钟复现生信套路各位小伙伴大家好，这里是美丽专栏。前面两期，我们复现了两篇非肿瘤生信文献，今天，我们继续开展非肿瘤文章的复现。话不多说，开始今天的复现之旅吧。往期传送门 TCGA+GEO单基因生信SCI，15分钟手把手带你复现（内附详细操作教程）最简配的2区生信SCI长啥样？360度无死角让你彻底搞懂，复现！思路原理都在这里了！建议收藏！（附详细操作过程） 别不信！近...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2023
05-13
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这篇最新二区7分 +SCI太牛了！平平无奇，零代码就能搞定？到底好在哪里 ？
今天给大家带来的复现比较经典文章是来自2区的Frontiers in Immunology杂志，影响因子高达7.5分！题目是： Hepcidin Upregulationin Lung Cancer: A Potential Therapeutic Target Associated With Immune Infiltration要素拆解题目：肺癌中铁调素升高可以作为潜在的免疫相关的治疗靶标 疾... 阅 读 全 部 >
2023
03-26
03-26
干货来啦！肿瘤生信挖掘必备数据库大合集！看这篇就够了！
TCGA生信挖掘必备数据库合集小伙伴们大家好，肿瘤相关的生信文章绝大多数离不开TCGA数据库（ https://portal.gdc.cancer.gov/）。但新手小白们可能对这个网站中的数据无从下手，或者仅仅知道寥寥几个相关网站还没能探索到相关的神奇功能。那么，我就来为大家总结一下TCGA生信挖掘必备的数据库合集吧！ 最权威的网站资源1.cBioPortal（http://www.cbiopo... 阅 读 全 部 >
2023
01-15
01-15
【表观遗传学基础】BS技术生物信息分析流程及原理
做个铺垫上次写的表观遗传学第一弹“如何研究DNA甲基化”的推文，反馈不错，小编还是有点小欣喜的！今天，小编打算把上篇提到的DNA甲基化的BS技术单独提出来，跟大伙儿详细介绍一下基于该技术的数据分析流程及实现。读过上篇的童鞋们已经了解到，BS技术就是基于亚硫酸盐将胞嘧啶C转化成为胸腺嘧啶T并测序。 上篇推文入口 >>Lister等在2008年首次通过该技术研究拟南芥和人的全基因组甲...... 阅 读 全 部 >
2023
01-15
01-15
Snakemake：简单好用的生信流程搭建工具
snakemake是什么？大多数生物信息初学者最早接触的生物信息分析流程，大多数是用脚本语言（Perl、shell、R、Python等）将生物信息流程中的各个功能写成一个个脚本，再用大脚本套小脚本的方式将整个流程打包封装。这种方式对编程能力有很高的要求，否则很容易出现流程bug、无法监控任务运行状态、无法有效查看任务日志等问题。等实验室终于出了个大牛将这些问题都解决了，可能大牛又要毕业了，新来的生... 阅 读 全 部 >
