大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。在全球范围内，牛为60多亿人提供了重要的营养来源。传染病是养牛生产的主要限制因素，且许多疾病人畜共患，因此与人类健康直接相关。近年来牛的许多复杂性状遗传基础得到了广泛研究，但不同动物的大量重要表型变化仍无法解释，人们越来越关注非遗传变异（包括基因表达、DNA甲基化和染色质）与重要牛表型的潜在相关性。为充分了解牛性状的非遗...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2020年4分+甲基化生信文章复现领悟生信文章逻辑之美，小伙伴们大家好呀，我是风间琉璃。上一周我们品读了2020年10月发表在《Frontiers in oncology》杂志上的文章“ A Novel Promoter CpG-Based Signature for Long-Term Survival Prediction of Breast Cancer Patients”。作者使用CHAM... 阅 读 全 部 >
大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。本期，我们讲讲全基因组DNA甲基化实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。一、全基因组甲基化测序技术原理表观修饰不需要改变 DNA 序列便能实现对性状的改变，表观修饰的改变与基因功能乃至细胞状态、发育、衰老、疾病等存在重要的关联。在众多的表观遗传修饰中，最为重要且研究最为...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。本期，我们讲讲甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。一、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)测序技术原理表观转录组指RNA序列不发生改变的情况下，由RNA上的化学修饰调节基因表达的现象。胞内RNA的...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。本期，我们讲讲cfDNA重亚硫酸盐测序(cfDNA-RBS)实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等方面详细介绍。一、cfDNA重亚硫酸盐测序(cfDNA-RBS)技术概述在⼈类基因组中，90%以上的CpG位点是被甲基化的，CpG位点的分布有两种形式，⼀种是少量分散在基因组中，另⼀种就是集中在启动⼦周...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。本期，我们讲讲m5C RNA甲基化重亚硫酸盐测序测序（RNA-BS）实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等方面详细介绍。一、m5C RNA甲基化测序（RNA-BS）技术原理m5C 是 RNA 百余种修饰中研究较多的⼀种。m5C 存在于 tRNA 上时，可以对翻译进⾏调节；存在于 rRNA 上时，可以...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
发表期刊：Microbiome (IF=14.652)发表时间：2022.2合作单位：南京农业大学样本类型：土壤DOI: 10.1186/s40168-022-01236-9研究背景在土壤微生物中，植物生长促进细菌 (PGPB) 是工程微生物组应用于农业的重要环节，包括改善生物控制和植物生长，PGPB 可以加强植物的养分吸收或调节植物激素水平，或通过抑制各种病原体和增强免...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
组蛋白（histone）是真核生物体细胞染色质中的一种碱性蛋白质，和DNA共同组成核小体结构。它们是染色质的主要蛋白质组分，作为DNA缠绕的线轴，在基因调控中发挥重要作用。 组蛋白修饰（histone modification）是指组蛋白在相关酶作用下发生甲基化、乙酰化、磷酸化等修饰的过程。组蛋白修饰在细胞中同DNA修饰以及组蛋白变体等表观遗传变化常被用作 动态调节染色质的结构和功能。这是因为组蛋... 阅 读 全 部 >
组蛋白（histone）是真核生物体细胞染色质中的一种碱性蛋白质，和DNA共同组成核小体结构。它们是染色质的主要蛋白质组分，作为DNA缠绕的线轴，在基因调控中发挥重要作用。 组蛋白修饰（histone modification）是指组蛋白在相关酶作用下发生甲基化、乙酰化、磷酸化等修饰的过程。组蛋白修饰在细胞中同DNA修饰以及组蛋白变体等表观遗传变化常被用作 动态调节染色质的结构和功能。这是因为组蛋... 阅 读 全 部 >
目前RNA修饰研究最多的是m6A甲基化，那么除了m6A，其他的修饰如m7G、m1A、m5C等也是一个研究热点。云序生物提供多种类型的RNA修饰测序，在不同领域均能找到发文契机。近期，云序客户东南大学附属中大医院章锐锋课题组和广东医科大学张晶晶课题组在BMC Genomics杂志上发表了两篇关于m7G修饰谱的文章。分别揭示了缺氧性肺动脉高压中的RNAm7G甲基化谱以及缺氧下斑马鱼脑中甲基化...阅读... 阅 读 全 部 >