长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展HPV(人类乳突病毒)整合入人类基因组,往往被认为是宫颈癌发展的重要环节之一,但具体的整合位置和机制目前尚未完全被揭示清楚。在本文中,来自浙大医学院附属邵逸夫医院和附属妇产科医院、华中科技大学和温州中心医院等单位的研究者采用Nanopore测序技术,对16 例HPV16阳性的宫颈肿瘤样品进行大规模检测,重点关注 病毒-人基因组整合事件;相关成果发... 阅 读 全 部 >
分类目录归档:网络资讯
2023
04-25
04-25
这是一篇“一看就懂”的单细胞测序文章!
今天跟大家分享一篇单细胞数据分析加简单验证实验的生信高分文章。对!没有其它分子类型或多组学数据联合分析,如果仅用scRNA数据发表10+文章?下面我们来一探究竟!文章题目:Single-cell analysis of human testis aging and correlation with elevated body mass index.研究背景衰老的男性表现出生...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
2023
04-24
04-24
进化论VS中性突变理论
进化论VS中性突变理论查尔斯·罗伯特·达尔文(英语:CharlesRobert Darwin,1809年2月12日-1882年4月19日),英国生物学家,其“进化论”被列为19世纪自然科学的三大发现之一(其他两个是细胞学说、能量守恒转化定律),对人类有杰出的贡献。达尔文早期因为地质学研究而著名,而后又提出科学证据,证明所有生物物种是由少数共同祖先,经过长时间的自然选择过程后演化而成。到了193..... 阅 读 全 部 >
2023
04-24
04-24
关联分析和连锁分析解析玉米籽粒大小的遗传结构|群体遗传专题
上上上期靠谱er在连锁分析和关联分析的稿子( 关联分析和连锁分析 | 群体遗传专题 )最后留了个尾巴,这次就把这个尾巴续上,讲讲连锁分析和关联分析的文献案例。总览玉米籽粒相关性状和产量直接相关。本文通过关联群体和双亲杂交群体解析三个籽粒性状(籽粒长度,籽粒快递,籽粒厚度)的遗传基础。在四种环境下共检测到21个和以上三个性状关联的位点。另又在7种环境下通过B73和Mo17构建的D...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2023
04-21
04-21
百迈客陆地棉泛基因组合作文章详解
2019年07月05日,Nature Communications在线发表了中国农业科学院棉花研究所与北京百迈客生物科技有限公司共同合作文章“Extensive intraspecific gene order and gene structural variations in uplandcotton cultivars”详细研究内容如下:英文题目:Extensive intraspecific... 阅 读 全 部 >
2023
04-16
04-16
欧洲银桦基因组登上Nature genetics
最近随着三代测序的火热,纯三代的基因组文章也遍地开花!技术的提升必然带来的基因组质量的提升,但是对做研究而言,最终还是得落到物种自身。下面这篇文章告诉你,没有熊猫血,怎么关注爆表。本文稿也将从项目专业角度来剖析欧洲银桦的NG之旅!研究背景森 林生态系统保有高份额的北半球生物多样性。北方森林大约占到全球森林的30%,且在各气候带中拥有最高的树木密度。此外,北方区域正在经历广泛的气...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2023
04-16
04-16
Nat Ecol Evol共同一作|鹦鹉螺基因组揭示针孔眼形成和生物矿化机制
近日,中国科学院南海海洋研究所喻子牛研究员团队鹦鹉螺基因组研究成果以“The genome ofNautilus pompiliusilluminates eye evolution and biomineralization”为题,在国际著名期刊Nature Ecology & Evolution(IF:12.544)上在线发表,百迈客生物科技作为共同一作共同参与研究。文中通过三代Pac... 阅 读 全 部 >
2023
04-15
04-15
密孔菌降解木材效应存在着保守的酶解反应机制
研究背景担子菌在木材分解方面具有重要的意义,大部分能够降解木材的物种都属于担子菌。白腐菌是属于担子菌亚门的真菌 ,因腐朽木材呈白色而得名。白腐菌是生物界中一类奇特的丝状真菌,是能够降解木材主要成分(纤维素、木质素和半纤维素)的微生物之一 ,它们对各种异生物质具有独特降解能力和降解机制。白腐菌对木质纤维素的降解很大程度上是一个复杂的酶学过程,需要一系列的水解和氧化酶的协同作用来完成,而且不同的白腐菌... 阅 读 全 部 >
2023
04-15
04-15
华中农大构建首个多物种中特异性蛋白介导的染色质环综合数据库ChromLoops
染色质环(或染色质相互作用)是染色质结构的重要组成元素(图1)。染色质环的破坏与癌症、多指畸形等多种疾病有关。目前,ChIA-PET、HiChIP和PLAC-Seq等技术可用于检测特异性蛋白质介导的高分辨率染色质环。近年随着3D基因组研究的快速进展,ChIA-PET、HiChIP和PLAC-Seq的数据集不断积累,亟需对这些数据集进行有效的收集和处理。图1. 染色质环(Chromatin loop... 阅 读 全 部 >
作者:微生态编译:微科盟牛魔王,编辑:微科盟茗溪、江舜尧。微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源《微生态》公众号。导读肠道微生物群与多种生理状态有关,但关于因果关系的争议仍未解决。在本研究中,我们利用全基因组、全宏基因组、人体测量和血液代谢特征数据对3432名中国人进行了双向孟德尔随机分析。我们确定了58个肠道微生物群和血液代谢物之间的因果关系,并复制了其中的4...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >