2022
06-25
06-25
Cytoscape:强大的pathway分析可视化工具
生信分析中我们经常会做KEGG和GO富集分析,一般拿到结果后就想到用柱状图展示pathway的富集情况。比如下面这样:如果学会使用Cytoscape中的ClueGO+CluePedia插件,可以帮我们更形象地展示pathway之间的关系,以及gene在pathway中的富集情况,论文插图瞬间提示一个档次,比如像这样:下面我们就来看一下如何使用Cytoscape中的Clue...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
作者介绍:黄升,普兰金融数据分析师,从事数据分析相关工作,擅长R语言,热爱统计和挖掘建模。目录使用Logistic和NaiveBayes建模Score Card原理Naive Bayes评分卡Logistics评分卡前言信用评分是指根据客户的信用历史资料,利用一定的信用评分模型,得到不同等级的信用分...阅读全文>>...
投稿系统网页顶部内容,登录个人账号即可查看。以完成所有内容提交后的确认界面内容开始, Step7:Review & SubmitStep 1:view and Respond to Decision Letter 进行确认Step 2:Type, Title, & Abstract 进行确认Step 3:Attributes(定语/属性,即关键词) 进行确认S...阅读全文>...
这一篇很早就想写了,一直拖到现在都没写完。虽然最近的社交网络上娱乐新闻热点特别多,想用来做可视化分析的素材简直多到不可想象,但是我个人一向不追星,对明星热文和娱乐类的新闻兴趣不是很大。还是更愿意把自己的精力贡献在那些不起眼的,然而却更能触动我们心灵与文化内涵的素材上来。今天要写的主题中国的世界遗产名录,我将使用简单的网络数据抓取,多角度呈现我国当前已经拥有的世界遗产名录数目、类别、地域分布、详情介...
这些使用技巧是搜罗网上的资源,根据自己的使用体验整理的,欢迎相互交流学习。一、 设置特定的Endnote引用文献输出格式不同的期刊或者会议,对于论文末引用文献的输出格式大不一样,虽然Endnote中大量的Style供你选择,但有时总是或多或少跟目标期刊的Style有些区别。能找到一样的Style最好,不能找到的话就编辑与目标期刊Style相似的Style进行编辑。其步骤如下:1...阅读全文>...
Linux 中经常看到利用 crontab 留后门,从接触的样本看多利用方式多是:① 是直接利用 crontab 命令;② 直接修改/etc/crontab。不论是样本,还是博客对其它方式讨论较少。本文主要讨论:① 计划任务有哪些类别;② 直接修改数据文件方式创建计划任务及其中的关键点;li...阅读全文>>...
一、Crontab查看编辑重启1、查看crontab定时执行任务列表crontab -l2、编辑crontab定时执行任务crontab -e3、删除crontab定时任务crontab -r4、相关命令:sudo service crond start #启动服务sudo service crond ...阅读全文>>...
Linux系统是生物信息分析中需要用到的系统,我们可以在服务器上或者个人电脑上安装Linux系统,从而使用生物信息软件进行生物信息数据分析,下面我们一步步的开始进行Linux系统的安装。安装步骤:准备一个U盘,电脑插上U盘,打开UltraISO软件,文件---打开,选择你下载好的CentOS-6.5-x86_64-bin-DVD1文件,点启动光盘--写入硬盘镜像,在硬盘驱动器里面选择你的...阅读...
RSeQC是一个RNA-Seq质控工具,提供了一系列有用的小工具能够评估高通量测序。其中一些基本模块:检查序列质量、核酸组分偏性、PCR偏性、GC含量偏性,还有RNA-seq特异性模块:评估测序饱和度、映射读数分布、覆盖均匀性、链特异性、转录水平RNA完整性等。下面我们就来介绍一下RSeQC的使用方法:#安装RSeQCtar zxf /opt/biosoft/RSeQC-2.6.4.tar.gz....
主要介绍Linux进程相关知识 及部分命令参考1.概述Linux是一个多用户、多任务的系统,能同时运行多个程序,从而产生多个进程。Linux进程中,进程和线程没有什么区别。Linux中的进程是一个数据结构,如下:struct task_struct { // 进程状态 long state; // 虚拟内存结构体 struct mm_struct *mm; // 进程...阅读全文>>...