2021 11-13 手把手学习TCGA数据库:SNP突变分析第二期 各位芝士的朋友好,今天我们继续聊我们的SNP话题,前面两讲我们分享了SNP发生的位置,发生的类型以及SNP的命名,并且特意提到了SNP的两个数据库,今天我们来学习一下这两个数据库的使用。dbSNPdbSNP 全称为The Single Nucleotide Polymorphism Database,即单核苷酸多态性数据库,意思是“DNA序列中的单一碱基对(base p...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2021 11-12 如何查找基因上的SNP位点 在医学文献中,经常会发现以基因名+突变信息命名的SNP,如UGT1A9*3 98T>C,如果我们要找到这个在染色体上的位置、对应的rs编号、或者要提取序列进行sanger测序验证时,这样命名的突变位点就很难查到对应的信息。此时,通过dbSNP详细的注释信息,也能找到这个位点,虽然命名形式不同。先打开dbSNP,检索要找的基因:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/proj... 阅 读 全 部 >
2021 07-31 干货分享——SNP分型检测 什么是SNP?SNP全称Single Nucleotide Polymorphism,即单核苷酸多态性,是指在基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,C和G)的突变引起的多态性。一个SNP表示基因组某个位点有一个核苷酸的变化,源于单个碱基的转换,颠换,插入和缺失。理论上讲,SNP既可能是二等位多态性,也可能是3个或4个等位多态性,但实际上,后两者非常少见,几乎可以忽略。通常所...阅读全文>... 阅 读 全 部 >