2023 03-02 怎么使用ROSE鉴定超级增强子 本篇文章给大家分享的是有关怎么使用ROSE鉴定超级增强子,小编觉得挺实用的,因此分享给大家学习,希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获,话不多说,跟着小编一起来看看吧。ROSE是最经典的超级增强子预测软件,由Richard A. Young大牛团队开发,源代码的网址如下http://younglab.wi.mit.edu/super_enhancer_code.html...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023 03-02 HACER human增强子数据库的示例分析 今天就跟大家聊聊有关HACER human增强子数据库的示例分析,可能很多人都不太了解,为了让大家更加了解,小编给大家总结了以下内容,希望大家根据这篇文章可以有所收获。大多数的增强子数据库利用chip_seq,DNase_seq和CAGE_seq的数据来鉴定增强子, HACER则通过GRO_seq和PRO_seq来分析增强子RNA,从而达到鉴定已经激活的增强子的目的。与其...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2023 03-01 超级增强子鉴定技术 超级增强子概念 超级增强子 (Super enhancer, SE) 是一类具有超强转录激活特性的顺式调控元件,2013年由美国学者Richard A. Young首次提出。与普通增强子 (Typical enhancer, TE) 相比,超级增强子区域跨度范围通常可达8~20Kb,远高于普通增强子...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2022 11-19 Enhancer 与 Super-enhancers 1. Enhancer 与 Super-enhancers1.1. 增强子(Enhancer)所谓增强子(Enhancer),位于结构基因附近,是一类非编码DNA顺式作用元件,在真核生物的发育过程中通过结合转录因子、辅因子以及染色质复合物作用于启动子,可以激活或增强基因的转录。简单说:增强子是能够增加启动子活性从而增加基因转录频率的DNA序列。图1. 增强子及复合物...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >