导语eLife是一个刊登生命和生物医学各领域高水平论文的开源在线期刊，开创性地推出了新的原型——允许科学家修改论文中的底层代码来调整图表，以方便科研工作者们验证，重构或更好地理解彼此的工作。编译：集智俱乐部翻译组来源：nature原题：Pioneering ‘live-code’ article allows scientists to play with each other’s results... 阅 读 全 部 >
以下帮助中心/知识库工具的选取是小编将百度、谷歌、搜狗、bing、知乎...搜索中，高频率出现的非广告类工具进行汇聚整，。不排除小编找到的是营销内容，建议大家使用之前，多多去了解内容来源由于很多平台不能直接发链接，所以小编将使用的搜索引擎和对应的标题名称写下来，感兴趣的朋友可以去搜索下。最全的在线帮助文档、知识库制作工具汇总，总有一款适合你！-百度...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
《R包学习》专栏·第2篇 文| R学习者3412字 | 9分钟阅读这是dplyr包系列第二篇文章。第一篇文章《dplyr包-列选择的方法 》总结了如何使用dplyr包有效地选择感兴趣的列。本文会总结列变换的方法，以实现按着需求对列做合理处理，例如：衍生新的列，列的离散化，列的拆分与合并等。列的变换操作，会介绍如下内容：增加一列增加多列列的离散化操作...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
众所周知，PubMed的检索页面并不直观，通常来说，我们难以通过PubMed的检索结果直接判断文献质量，而需要通过其他网站收集期刊影响因子、文献引用次数等信息，综合判断文献质量。于是，为了简化查找文献的过程，使PubMed检索结果更清晰，一些好用的插件应运而生。今天我们就给大家安利一个适用于PubMed的神仙插件~EasyPubMedEasyPubMed是一款功能非常全面的插件，能够直接在PubM... 阅 读 全 部 >
本文讨论了一个重要的 Linux shell 环境变量，称为 PATH，以及如何向该变量添加目录。通常，您在 Linux 系统上运行的大多数程序都可以完美运行，并且您的 shell 在执行时不会出现任何错误。但是，有时您可能希望从 Linux 系统上的非标准目录快速运行自定义脚本或程序。在这种情况下，您需要将它们的源目录添加到 shell 的 PATH 变量中，以便它知道...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
细胞色素P450（cytochromeP450或CYP450），为一类亚铁血红素—硫醇盐蛋白的超家族，它参与内源性物质和包括药物、环境化合物在内的外源性物质的代谢。在真菌中，次级代谢产物的合成和外来化合物的代谢有着重要作用，许多化合物的生物转化是由CYP450介导的，在实际应用上，CYP450在农药降解中也起着重要作用。虽然Nr数据库中有部分微生物的P450信息，总体来说，信息都不够全面。今天我们... 阅 读 全 部 >
蛋白质是调控生命功能的基本层次，在生命科学研究上具有重要意义，因此受到科研工作重点关注！也是很多小伙伴发文的热点方向！但由于执行复杂生命功能的蛋白质的结构和功能等的多样性都很高，收录蛋白质信息的数据库往往各有所侧重。 面对网上一搜，名目繁多的蛋白质数据库，不少小伙伴会无所适从。那么，我们平时使用的那些常用蛋白数据库，都适合来找一些什么数据呢？以下，小编选了一些平时常用的蛋白质数据库，整理给大家。0... 阅 读 全 部 >
发表期刊：Microbiome (IF=14.652)发表时间：2022.2合作单位：南京农业大学样本类型：土壤DOI: 10.1186/s40168-022-01236-9研究背景在土壤微生物中，植物生长促进细菌 (PGPB) 是工程微生物组应用于农业的重要环节，包括改善生物控制和植物生长，PGPB 可以加强植物的养分吸收或调节植物激素水平，或通过抑制各种病原体和增强免...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
by 老马上几期我们介绍了lncRNA的研究：1）什么鬼，lncRNA原来这么分析？2）实例解读|高分文章|lncRNA-miRNA作用于心脏肥大；3）实例解读| lncRNA在胃癌中的作用；4）最全长链非编码RNA数据库介绍（上）；5）GWAS+lncRNA是否能成为后基因组研究的宠儿？反映不错！大家对lncRNA的研究很感兴趣。这一期小编继续为大家分享一篇lncRNA+miRNA+m...阅读... 阅 读 全 部 >
当当当当，基迪奥有参转录组升级啦，升级的部分从最开始的比对参考基因组，到最实用的差异分析和富集分析都有。想要了解转录组分析点的朋友们，赶紧看过来吧~首先，来看一下我们的分析流程，由于动植物的非模式生物与人大小鼠的模式生物的基因组、研究侧重点不一样，因此我们将报告拆分成了农学和医学的报告。基于非模式生物的基因组不够完整的特点，我们会进行新基因鉴定和基因结构优化的分析；而由于人大小鼠的基因组非常的完善... 阅 读 全 部 >