近日，美国麻省理工学院联合Broad研究所、加州大学等研究团队在 Nature genetics 上发表了题为“Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data”的研究文章。研究人员引入了 单细胞疾病相关性评分（scDRS），这是一种在单细胞... 阅 读 全 部 >
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AnimalTFDB：动物转录因子注释和预测tool
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经验分享：非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）简介
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山东农科院、北林等开发异源多倍体亚基因拆分新算法
近日，美国麻省理工学院联合Broad研究所、加州大学等研究团队在 Nature genetics 上发表了题为“Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data”的研究文章。研究人员引入了 单细胞疾病相关性评分（scDRS），这是一种在单细胞... 阅 读 全 部 >
2024
01-22
01-22
STR鉴定报告怎么看？
STR检测流程首先了解下STR检测流程，先提取细胞DNA, 然后进行PCR扩增及测序，最后进行结果分析。详细检测流程请看下图：▲图1 STR检测流程* Dr.Cell 采用的细胞STR鉴定方法完全符合美国国家标准局（NIST）颁布的细胞鉴定标准-ANSI/ATCC ASN-0002-2011, 并且在中国CMA认证与司法鉴定许可的实验室进行检测。STR位点基因分型结果完整...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2024
01-15
01-15
小鼠细胞STR鉴定
用荧光PCR扩增小鼠基因组中9个STR基因座位，PCR产物在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测进行基因分型。根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库（EXPASY）比对，从而进行小鼠细胞STR鉴定。小鼠STR分型图谱及检测结果示例阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2024
01-14
01-14
细胞STR分型检测 STR分型检测 STR分型报告 人源细胞STR分型
短串联重复序列（short tandem repeat, STR）是核心序列为2-6个碱基的短串联重复结构。20世纪90年代初，STR基因座首次作为一种重要的遗传标记在人类亲权鉴定中被使用（Edwards et al.,1992；Edwards et al.1991）。细胞STR分型（cell line STR genotyping）D19S433、D5S818、D21...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2024
01-01
01-01
赛库 | 细胞培养全指南（多年实战经验汇总）
楔子细胞是生物学实验的重要材料，也是生物细胞学实验的基础，药物、基因功能、疾病机理等的相关研究多数需要在细胞水平进行阐释。而细胞培养，受人员操作和环境条件的影响比较大，在细胞培养中常常会遇到很多的细节问题，而每个问题都有可能导致细胞培养的失败。赛库生物不仅致力于提供高品质的细胞材料，而且我们还要帮大家把买到的细胞养好，助力大家细胞实验的顺利开展。于是我们汇总了公司细胞实验室多年来的细胞培养经验..... 阅 读 全 部 >
2024
01-01
01-01
小鼠细胞鉴定(Mouse Cell Line Authentication) FAQs
原创作者：Xiankun Zhao1.小鼠细胞也需要进行细胞鉴定吗？答：作为基础研究中的第二大常用细胞株模型，小鼠细胞目前也面临着错误识别、交叉污染的问题。因此，与人源细胞株一样，越来越多的SIC期刊以及资金机构都要求提供小鼠细胞鉴定报告。2.通过什么方法可以对小鼠细胞进行身份鉴定？答：与人源细胞株一样，STR分型是小鼠细胞鉴定的标准方法。小鼠特异性的...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2024
01-01
01-01
FFPE样本制备及分析——DNA样品质控&实用研究| 实验技术专题
DNA样品质控尽管最佳的裂解和孵育条件可从FFPE样品中释放DNA，部分逆转甲醛修饰，但对于纯化后DNA的下游分析，仍有一些限制。首先，固定过程中的化学修饰可能引入不想要的序列变化，降低DNA稳定性和酶学分析的效率，让A260/A280的纯度分析变得困难。其次，由于FFPE样品中的DNA随时间而逐渐片段化，故只能分析短序列（例如在PCR应用中，应当设计产生短扩增子的引物）。此外，较短的D...阅读... 阅 读 全 部 >
2023
12-31
12-31
10x Genomics FFPE样本单细胞转录组+空间转录组解决方案
FFPE（formalin fixation and paraffin embedding）样本，即福尔马林固定石蜡包埋的组织样本。它承载了众多疾病的关键信息，又可长期室温保存，所以是病理科当之无愧的“瑰宝”。在世界范围内，大约有数十亿份组织样品存储在医院或生物样本库中，其中绝大多数是FFPE样本。但是，FFPE样本也因为福尔马林的固定容易使组织中的核酸发生不同程度的降解和分子间...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2023
12-31
12-31
「如何FFPE样本中获得高质量DNA？」，带你解锁！
FFPE样本是医学领域常见的生物材料。此类样本已经被广泛应用于高通量测序、原位杂交、免疫组织化学等研究领域。目前，全球约有数亿FFPE组织样本,这些组织样本已经是疾病诊断和科学研究的最为宝贵的生物学资源之一。从FFPE中获得高质量核酸，是顺利推进下游实验的第一步。那么，如何从FFPE样本中获得高品质的核酸来进行下游实验呢？今天小编就来为您支招儿！01什么是FFPE样本？FFPE（For...阅读全... 阅 读 全 部 >
2023
12-19
12-19
FFPE样本的空间转录组是怎么做的？
上期我们介绍了空间转录组冰冻组织样本的制备，那么这期就来聊一聊空间转录组FFPE样本的那些事儿。FFPE样本常用于储存临床上的病理组织，是珍贵的医学研究材料，但由于FFPE样本固定时福尔马林的使用和保存时间久等原因，导致核酸存在不同程度的降解，使得研究基因表达颇为棘手。10x Genomics经过探索推出了Visium FFPE空间基因表达解决方案，不仅突破了这个障碍，能从 FFPE 样本...阅... 阅 读 全 部 >