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2022
10-02

网络工程师 | Linux环境变量配置

Linux环境变量配置在自定义安装软件的时候，经常需要配置环境变量，下面列举出各种对环境变量的配置方法。下面所有例子的环境说明如下：系统：Ubuntu 14.0用户名：uusama需要配置MySQL环境变量路径：/home/uusama/mysql/binLinux读取环境变量读取环境变量的方法：export命令显示当...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
08-18

STRING数据库的蛋白质相互作用（PPI）网络分析

在转录调控相关的文献中，我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络（protein protein interaction network，PPI network）。具体而言，这些相关的文献中首先通过RNA-seq、表达谱芯片或者蛋白质组分析等，找到了在不同分组样本间一系列的差异表达基因或蛋白。随后，通过STRING数据库（https://string-db.org/）检索了编码蛋白间...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2022
07-10

ceRNA常用鉴定和预测工具介绍

已经陆续为大家介绍了ceRNA研究的建库方法（文章：），还有ceRNA之间的调控关系（文章：），这篇就来总结一下miRNA、 lncRNA、circRNA鉴定及靶向关系预测常用的分析工具。 miRNA鉴定去除低质量的数据，得到clean data后，还需要和Genebank、Rfam等数据库比对去除rRNA，scRNA，snoRNA，snRNA，tRNA等其它小RNA的tags，最后再进行mi..... 阅 读 全 部 >
2022
07-01

ceRNA介绍及分析研究策略

前言现在生物学研究中对RNA的研究与日俱增，siRNA，piRNA，miRNA, LncRNA一个个明星分子层出不穷。更有一些新的名词不断产生，如ceRNA。其实ceRNA的提出也有一段时间了，而且它并不是一种新的RNA分子，而是一种调控机制。在最近的研究中表明基因在转录调控中存在多种模式作用，microRNA作为其中一种重要的调控因子，是长短约22nt的短链RNA，能够通过抑制目...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022
05-19

想要get到WGCNA，这篇就够了~

纵观近十年发表的转录组学文章，转录组应用的研究领域越来越广泛，数据的挖掘要求越来越高，实验设计方案涉及的样本数目日趋增多，这就对转录组数据的生物信息分析方法有更多更高的需求。今天跟大家分享的WGCNA（Weighted Gene Co-Expression Network Analysis），就是适合进行复杂转录组数据分析的工具。首先，我们了解一下WGCNA的概念WGCNA其译...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2022
01-24

中国四大骨干网 六大运营商 八大节点

除了CHINANET外，中国还有CERNET，CSTNET，CHINAGBN网网络，合起来称为中国四大骨干网。☆中国公用计算机互联网（CHINANET）又称邮电部互联网、中国公用Internet网，是邮电部经营管理的基于Internet网络技术的电子信息网，1995年初与国际互联网连通，并于5月向社会提供服务。CHINANET由骨干网、接入网组成，骨干网是其主要信息通路，由直辖市和...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2016
01-14

这三年，习近平治网有“数”

编者按|网络是数字科技，而十八大以来，以习近平为总书记的党中央高度重视网信事业的发展，治网有“数”，管网有方，我国网络信息化建设突飞猛进，正在向建设网络强国的战略目标奋勇迈进。请看中国日报网“习近平治国理政系列”第四篇《习近平治网有“数”》。2015年12月16日，第二届世界互联网大会在浙江省乌镇开幕。国家主席习近平出席开幕式并发表主旨演讲。 （新华社记者 李涛 摄）一...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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