分类目录归档：科研&学习

2024
02-06

经验分享：非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）简介

非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）是一种独特的RNA转录本，占人类基因组RNA的90%以上，除少数具有开放阅读框，因而具有编码潜能以外，通常不编码蛋白质，而是作为发育、增殖、转录、转录后修饰、凋亡、细胞代谢等多种生物过程的重要调控因子。广义上讲，转运 RNA ，核糖体 RNA ，核内小分子 RNA 及核酶等都属于非编码 RNA, 对于这些非编码 RNA 的结构和功...阅读... 阅 读 全 部 >
2024
02-05

山东农科院、北林等开发异源多倍体亚基因拆分新算法

多倍化是基本的生物演化方式，也是重要的植物技术。在植物和其他真核生物中，多倍化对形态、生理和适应性变异的形成有重大贡献。多倍化包含两个或更多的基因组，形成了大量的重复基因，从而为丰富的变异提供更广泛的缓冲作用，多倍体个体往往有突出的产量和抗逆性优势。多倍体在作物和林木育种中都有突出价值，显著促进了重要性状改良，如小麦的高品质、芸苔属的多样化形态、草莓的不同香气和风味特征、杨树多倍体的巨大体型和速生... 阅 读 全 部 >
2024
02-05

昆明植物所为深入探索复杂多倍体植物亚基因组演化带来新路线

多倍体是真核生物演化的关键驱动因素，尤其在被子植物中驱动了物种的多样性演化和性状创新。异源多倍体是多倍体的主要形式之一，起源于物种间杂交事件，最终在单个生物体内聚合两个或多个不同二倍体物种的基因组，因此具有更高的遗传多样性和适应潜力。多倍化发生后，异源多倍体基因组经历二倍化和基因fractionation的演化过程，这一过程涉及染色体重排和基因丢失以及同源交换(HEs)可能会模糊这些异源多倍体物种... 阅 读 全 部 >
2024
02-04

UCSC LiftOver工具对不同版本的基因组坐标进行转换

人类基因组计划自启动以来，目前已经出了很多版本的人类基因组，例如hg18, hg19, GRCh37, GRCh38。为了将不同版本的基因组位置信息一一对应，UCSC 推出了一个基于基因组序列的转换工具LiftOver。它能够快速准确的将不同版本的基因组坐标进行相互转换，已被广泛应用于各种基因组研究之中。UCSC分别提供了网页版和Linux命令行两个版本的LiftOver工具。网...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
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