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2025
07-27

Nature Methods：让长读长测序来拯救基因组组装

自测序技术问世以来，利用 DNA 序列的片段来组装人类、动植物或微生物的基因组就一直是难题。许多参考基因组都存在缺陷，如组装错误或存在缺口。人类参考基因组 GRCh38 就有数百个缺口，缺失了大约 150 Mb 的序列。随着高精度长读长测序技术的出现，这种状态正在改变。《Nature Methods》杂志上近日发表了一篇题为 “Long road to long-read asse...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2025
07-25

Nanopore全长转录组测序数据评估，来也！

纳米孔测序是一种由ONT（Oxford Nanopore Technology）研发的单分子测序技术。在转录组测序应用中，相比于传统二代RNA-Seq测序技术，长读长的纳米孔RNA测序可以在无需打断的条件下得到全长序列并进行定量，同时直接RNA测序还可以检测多种碱基修饰，且测序无需扩增，减少了PCR过程引入的碱基偏倚。ONT测序技术在多个方面具有非常强悍的优势，然而，一份合格的下机数据才是科研成功... 阅 读 全 部 >
2025
07-24

Pacbio全长微生物多样性测序原理及实测结果展示

近年来，微生物群落结构多样性一直是科研工作者研究的热点，微生物“个 头小，本领强”，从人体的皮肤、口腔、胸腔、阴道到肠道、粪便，无处不在，又称为“人体第二基因组”，在人体中发挥着巨大的作用。还广泛存在于土壤、水体、发酵液、植物、空气等环境样本中，它们推动着地球物质循环，影响着人体乃至整个地球生物圈的健康。 传统研究中，是将环境样本中的微生物进行分离培养，提取已经分离培养出来的每一个纯菌的DNA，针... 阅 读 全 部 >
2025
07-19

利用全长转录组多重阵列测序检测同源异构体

哈佛大学和麻省理工学院近期发表了“High-throughput RNA isoform sequencing using programmable cDNA concatenation.”研究论文中，将 cDNA 串联成可用于长读长测序最佳的单分子的技术应用于肿瘤浸润 T 细胞的单细胞 RNA 测序,提高了寻找可变剪接基因的准确度，验证了 T 细胞中典型的 PTPRC 剪接模式...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
2023
01-16

Pacbio全长转录组测序

全长转录组研究是理解生物机体功能的一个重要途径。传统二代转录组测序无法直接获得单个RNA分子由5ˊ到3ˊ的全部序列。基于PacBio三代测序平台的转录组研究，无需打断，直接读取反转录的全长cDNA,能够有效的获取高质量的单个RNA分子的全部序列，准确辨别二代测序无法识别的同源异构体（isoform）、同源基因、超家族基因或等位基因表达的转录本。  分析内容  结...阅读全文... 阅 读 全 部 >