2021 07-19 单细胞ATAC-seq——探索基因转录调控的新利器 近年来,ATAC-seq技术成为研究基因表观组学的新利器,在Cell、Nature等顶级期刊发表了多篇高分文章。这些研究主要通过ATAC-seq来研究表观遗传学调控,包括信号通路、细胞发育、疾病发生等,同时结合motif分析来识别哪些转录因子参与基因表达调控。表1 ATAC-seq发表的部分高分文章什么是ATAC-seq?染色质开放区:真核生物染色体是由DNA分子包裹组蛋白形成的核小体结构通过一系... 阅 读 全 部 >
2021 07-19 五分钟带你了解ATAC-seq测序 ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing,中文可理解为结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。这个方法是2013年由斯坦福大学的William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室共同开发的用于研究染色质可及性/开放性的方法。目前,通过A... 阅 读 全 部 >
2021 07-05 研究开放染色质,你在用哪一种 根据前文表观遗传学研究你知道多少?——ATAC-seq可知,开放染色质的研究,对于寻找转录前调控核心因子至关重要。本次小编重点给大家介绍几种利用现有测序技术快速获取开放染色质区域的全部信息。1、最直接的开放染色质区域检测技术——DNase-seq技术2008年面市的DNase-seq技术是比较早出现的,基于二代测序平台的开放染色质区研究技术。该技术使用核酸内切酶DNase I。...阅读全文>... 阅 读 全 部 >