2022 05-17 WGCNA分析,简单全面的最新教程 WGCNA基本概念加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation networkanalysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度协同变化的基因集,并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或治疗靶点。相比于只关注差异表达的基因,WGCNA利用数千或近万个变化最大的基因或全部基因的...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2022 05-13 如何利用WGCNA分析转录组数据? 一、WGCNA分析简介随着转录组测序价格下降,进行测序的样本数也在逐渐增多,WGCNA(weighted gene co-expression networkanalysis,权重基因共表达网络分析)这种适合大样本的分析方法,在疾病以及其他性状与基因关联分析等方面应用越来越广泛。WGCNA最大的优势在于,能将多个样本中成千上万的基因,根据它们的表达模式划分到数个至数十个模块当中,然后以模块...阅... 阅 读 全 部 >
2022 05-13 基因共表达网络分析(WGCNA)教你寻找已知功能基因的调控基因 研究背景雌激素是一种甾体激素,对雌性繁殖有广泛的影响。在生殖期,雌激素的合成主要在卵巢卵泡的体细胞(卵泡膜细胞,TCs和颗粒细胞,GCs)中。然而在哺乳动物和鸟类中其合成位置并不相同。在哺乳动物中,TCs从头产生雄激素,GCs进行雌二醇转化。然而由于未知的原因,在鸟类中TCs产生睾酮和雌二醇(一种雌激素)。CYP19A1编码芳香酶,是负责雌激素的生物合成的关键步骤。哺乳动物牛中,雌...阅读全文&... 阅 读 全 部 >