来源：解螺旋·医生科研助手导语我们把筛出来的差异表用一种直观的图表示出来，一般使用热图（heatmap）将差异表达基因进行数据可视化处理，传统的方法采用R语言包里面的（heatmap）函数对其进行绘制，这里重点讲解一下heatmap包各个常用参数的使用，如果要求较高可以采用这种方法来画图。另外，如果要求不高，也可以使用Heatmap builder这个软件做图，窗口化操作，方法简单。...阅读全文... 阅 读 全 部 >
热图是科研论文中一种常见的可视化手段，因其丰富的色彩变化和饱满的信息涵盖量，往往是一篇文章中最引人注目的所在之一。上至 CNS 顶刊，下至1到 2分小文，可以说热图无处不在，堪称文章C位。如何做出一张完美的热图，是居家旅行（科研写作），拜访亲朋好友（征服 editor和reviewer 的心）必备技能。本次教程，我们将为大家详细讲述如何使用R语言绘制高大上的热图。什么是热图...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
编者按热图：通过热图可以简单地聚合大量数据，并使用一种渐进的色带来优雅地表现，最终效果一般优于离散点的直接显示，可以很直观地展现空间数据的疏密程度或频率高低。你还不会画热图吗？不管您是做蛋白组学、代谢组学或者多层组学研究。热图是文章里常见的图，色彩变化丰富的热图为文章亮色不少。热图可以说是生信中最为常见的图形可视化方式，用以展现表达分布模式。热图可以用于解决组学研究的什么问题？根据...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
【Pheatmap 绘制多分组热图】热图作为实验数据分布情况的直观展示方法，已经成为高分文章的不错选择，它不仅可以对数据质量进行具像化展示，还可以对数据和样品进行聚类。在R中有多个包均可绘制热图，今天小锐给大家介绍一个可以绘制多个分组热图的R包， libarary（pheatmap）。首先是准备工作install.packages("pheatmap")#安装R包library(ph...阅读全文... 阅 读 全 部 >
R语言非常讲究数据的整理，我们在7-13天的R语言学习内容中，着重都是关于R语言的整理，各种方法对数据进行整理，查看，对变量进行转换。dplyr包，主要也用于数据清洗和整理，该包专注dataframe数据格式，从而大幅提高了数据处理速度。这个包对数据处理的方式相对之前的方法，更加简单，是医学数据分析必须要掌握的包。dplyr包存在着上百个函数来帮助进行数据的整理，由于篇幅的关系，本...阅读全文&... 阅 读 全 部 >