lncRNA如何预测其靶基因?
整个流程可以用两句话总结:将IP与input进行callPeak的结果与已知lncRNA进行相交,将交集得到的lncRNA进一步查找其附近具有功能的Protein-coding基因,随后对这些基因进行功能富集分析。 如下图所示,流程图展示了如何使用RNA数据进行lncRNA的查找与其靶基因功能注释,IGV则将这个过程找到的基因进行可视化。
流程图示:
IGV示意图示:
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