通过单细胞转录组测序技术得到海量细胞的表达矩阵，可以对细胞亚群做聚类、注释，鉴定亚群markergenes，寻找组间差异调控网络，绘制组织特异性图谱.....除了这些基本分析思路外，还有没有其他方法可以挖掘出隐藏在丰富数据里的宝藏呢？今天细胞轨迹分析告诉你~一个组织样本中同时含有处于不同分化阶段的细胞，单细胞转录组测序技术一个样本可检测上千甚至上万个细胞，记录下样本中成千上万个细胞的瞬时信息，..... 阅 读 全 部 >
在单细胞样本制备过程中，新鲜组织经历解离-离心-重悬-过滤-质控（计数和活率）-上机等步骤。这一过程具有破坏性，根据裂解后的细胞释放出的mRNA反转录成的cDNA进行测序，不可避免地导致 失去了不同细胞之间的空间位置信息和细胞分化情况。单细胞轨迹分析应运而生，轨迹分析可以通过构建细胞间的变化轨迹来重塑细胞随着时间的变化过程，帮助人们从单细胞水平推断细胞之间的演化及分化过程。简单来讲 细胞轨迹...... 阅 读 全 部 >
Hi，大家好，我是晨曦根据各位小伙伴的私聊以及前几期推文的阅读量来看，可能Python并不能并不是十分契合现阶段小伙伴的需求，而且也有小伙伴私信晨曦，希望晨曦可以再更新一些单细胞相关的分析内容，说自己常规的细胞轨迹分析、细胞通讯分析以及转录因子分析已经不能满足自己的需求了~那么好，晨曦接下来会更新一些单细胞新出的高阶分析，争取做一个单细胞高阶分析“百科全书”，也希望各位小伙伴如果觉得内容不错，也欢... 阅 读 全 部 >