2023 03-04 WES(1)测序质量控制 这一步主要看看这些外显子测序数据的测序质量如何:首先用fastqc处理,会出一些图表,肯定是没问题的啦,如果数据有问题,公司就不会给你,那样不砸了他们自己的招牌嘛。然后我们粗略统计下平均测序深度及目标区域覆盖度,这个是重点,不过一般没问题的,因为现在芯片捕获技术非常成熟了,而且实验水平大幅提升,没有以前那么多的问题了。这个外显子项目的测序文件里面,...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023 01-01 ATAC-Seq分析教程:对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估(二)ChIPQC—科研必备表观遗传学知识 ATAC-Seq剖析教程系列ATAC-Seq剖析教程:ATAC-seq的布景介绍以及与ChIP-Seq的异同ATAC-Seq剖析教程:原始数据的质控、比对和过滤ATAC-Seq剖析教程:用MACS2软件call peaksATAC-Seq剖析教程:对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评价(一)phantompeakqualtoo...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >