2023
05-03
05-03
单细胞数据分析干货——Loupe之数据过滤和重聚类
通常,运行完Cell Ranger得到的a.cloupe文件会得到所有细胞的默认分群结果。但是这些数据并没有进行严格的数据过滤,其中可能包含了很多细胞、死细胞或者状态不好细胞的信息。之前版本的loupe没有数据过滤后重聚类的功能,要实现这些数据的过滤我们一般会借助第三的分析软件比如seurat,现在10x Genomics公司已经对loupe进行了升级,升级到5.0之后只需要简单的几步操...阅读... 阅 读 全 部 >