RSeQC是一个RNA-Seq质控工具，提供了一系列有用的小工具能够评估高通量测序。其中一些基本模块：检查序列质量、核酸组分偏性、PCR偏性、GC含量偏性，还有RNA-seq特异性模块：评估测序饱和度、映射读数分布、覆盖均匀性、链特异性、转录水平RNA完整性等。下面我们就来介绍一下RSeQC的使用方法：#安装RSeQCtar zxf /opt/biosoft/RSeQC-2.6.4.tar.gz.... 阅 读 全 部 >
主要介绍Linux进程相关知识 及部分命令参考1.概述Linux是一个多用户、多任务的系统，能同时运行多个程序，从而产生多个进程。Linux进程中，进程和线程没有什么区别。Linux中的进程是一个数据结构，如下：struct task_struct { // 进程状态 long state; // 虚拟内存结构体 struct mm_struct *mm; // 进程...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
在这篇指南中，我们会逐步对进程做基本的了解，然后简要看看如何用特定命令管理 Linux 进程。进程(process)是指正在执行的程序;是程序正在运行的一个实例。它由程序指令，和从文件、其它程序中读取的数据或系统用户的输入组成。进程的类型在 Linux 中主要有两种类型的进程：前台进程(也称为交互式进程) - 这些进程由终端会话初始化和控制。换句话说，需要有一个连接到...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
NIST数据库提供谱库检索，图谱解析，同位素计算等多种功能，对质谱检索及解析很有帮助，是非常好用的代谢物检索工具。下面我们就来介绍一下使用方法：操作步骤进入网站，选择检索方式，可以是化学式，化合物名称等等。http://webbook.nist.gov/chemistry/填入信息进行检索选择需要的化合物进行查看选择相应的信息进行查看结果包括化学式，分子量，化学结构，还可以下载2D和3D的结构进行... 阅 读 全 部 >
透过期刊论文被引用的次数（Time Cited），可以反映这篇论文对之后研究的影响程度。一般而言，引用次数愈高者，表示有愈多人参考引用这篇文章，其影响也就愈深远。除了观察引用次数的高低、计算引用次数的平均值 (Average Citation) 之外，还可以利用 h-index 得知某一作者或系所整体论文发表的质与量喔。J.E. Hirsch 于 2005 年提出统计指标 ...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
首先我们百度百科一下，什么是H-index：h-index ，又称为h指数或h因子（h-factor），是一种评价学术成就的新方法。h代表“高引用次数”（high citations），一名科研人员的h指数是指他至多有h篇论文分别被引用了至少h次。h指数能够比较准确地反映一个人的学术成就。一个人的h指数越高，则表明他的论文影响力越大。例如，某人的h指数是20，这表示他已发表的论文中，每篇被引用了至... 阅 读 全 部 >
在这篇指南中，我们会逐步对进程做基本的了解，然后简要看看如何用特定命令管理Linux进程。进程process是指正在执行的程序；是程序正在运行的一个实例。它由程序指令，和从文件、其它程序中读取的数据或系统用户的输入组成。进程的类型在Linux中主要有两种类型的进程：前台进程（也称为交互式进程）–这些进程由终端会话初始化和控制。换句话说，需要有一个连接到系统中的用...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
前言Linux中的一些小技巧可以大大提高你的工作效率，本文就细数那些提高效率或者简单却有效的linux技巧。命令编辑及光标移动这里有很多快捷键可以帮我们修正自己的命令。接下来使用光标二字代替光标的位置。删除从开头到光标处的命令文本ctrl + u，例如：$ cd/proc/tty; ls-al光标如果此时使用ctrl + u快捷键，那么该条命令都会被清除，而不需要长按backspace键。删除从.... 阅 读 全 部 >
在我们的工作生活中，不管是程序员还是非程序员，都会遇到一个需求，那就是对一堆文件进行重命名。在 Windows 下有很多优秀的软件可以帮助我们完成这个需求，而在 Linux 环境下，我们可以简单敲一些代码就可以完成这个需求。本文将介绍三种最基本的文件重命名方法，因为比较基础，所以老司机可以到此为止。rename 命令顾名思义，rename 命令就是用来进行重命名文件名的。rename 命令有非常强... 阅 读 全 部 >
cp 和 mv 之外，在 Linux 上有更多的复制和重命名文件的命令。试试这些命令或许会惊艳到你，并能节省一些时间。Linux 用户数十年来一直在使用简单的 cp 和 mv 命令来复制和重命名文件。这些命令是我们大多数人首先学到的，每天可能有数百万人在使用它们。但是还有其他技术、方便的方法和另外的命令，这些提供了一些独特的选项。首先，我们来思考为什么你想要复制一个文件。你可能需要...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
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