之前说过SNP检测的相关方法，关于SNP的相关的内容可以参考（SNP检测方法 ）。相比于检测方法，可能更关键的是如何确定要检测的SNP位点。那么如何选择跟自己研究相关的SNP位点呢？
今天就简单聊一下几种选择SNP位点的方法：
1.前期有相关的实验数据的情况
前期实验数据包括：家系的全外显子测序数据、相关病例的测序数据等，可以根据前期的测序的数据进行分析(一般由测序公司来完成)。
具有家系完整数据的可以根据 孟德尔遗传定律进行分析，找到符合孟德尔遗传定律的位点进行后续的功能实验研究，进而根据自己课题内容进行相关疾病的关联即可。
没有完整的家系数据的则需要根据研究的疾病，根据发病率、病情进展程度等 相关临床数据进行疾病的关联分析，从而确定跟研究内容相关性高的SNP位点进行后续的功能实验。
2.候选基因（位点）法
如果没有相关前期的实验数据时，需要根据自己研究的课题，从文献中找到自己 课题相关的基因合（位点）等信息。
收集到的信息可能数量比较大，这时需要根据自己的研究课题，选择跟自己课题 相关性更高，且具有一定 创新性的位点，进行后续的SNP样品检测和功能实验。
3.直接选择法（自创）
那如果小伙伴说我既没有前期数据也不想查这么多怎么办？这不是坑么？
于是小坑冥思苦想，总算想出来一种不是很坑的方法
首先要借助NCBI 的SNP数据库，以GAPDH为例进行讲解
可以看到仅有GAPDH已知的序列就有2320个，接下来需要选择自己感兴趣的SNP位点。
由于决定基因功能的是蛋白序列，所以首先选择的是可以引起蛋白序列改变SNP位点，所以做如下选择
接下来是这样的
可以看到SNP位点只剩205个，截图中的rs1062429位点，引起的蛋白质变化为箭头所指。
此时可以根据研究的蛋白结构域，修饰位点等相关信息，选择跟自己研究相关的SNP位点进行后续的功能研究和位点检测、关联分析。
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