新一代测序技术的发展使测序成本大为降低，测序数据也呈现爆炸式的增长。其中，转录组数据RNA-seq最受研究人员欢迎。通过分析感兴趣的器官/组织/细胞中的基因表达模式，研究人员可以更好地了解基因在不同发育时期、不同环境或是处理条件下表达水平的变化，从而进一步分析基因功能。
处理大型RNA-seq数据集的工具eFP‐Seq Browser实现了用户友好的基因表达分析和可视化。说起可视化工具，大家最熟悉的当属TAIR的eFP‐Seq Browser工具：
或者是
近日，来自加拿大多伦多大学的研究人员在Plant Journal发表了标题为“An “eFP‐Seq Browser” for Visualizing and Exploring RNA‐Seq Data”的文章，推出了一款功能更为强大的eFP‐Seq Browser工具。
该网站显示了每个样本中感兴趣基因的图谱覆盖率以及“电子荧光图像”（eFP）。同时还总结了每个RNA-seq实验的细节，提供了SRA数据库和PubMED的链接，并自动计算RPKM表达水平数据和相关系数分数。此外，研究人员还可以根据基因的表达水平或基因剪接变体的不同程度对样本进行排序，以快速识别具有高表达水平的样品或可能发生选择性剪接的样品。研究人员还可以下载eFP-Seq浏览器中汇总的RNA-seq比对的详细信息，通过集成基因组浏览器桌面可视化工具，将其转换为可视化的覆盖图。
网站链接：https://bar.utoronto.ca/eFP-Seq_Browser/
结果展示页面如下：
左边菜单还有很多功能！
一次性导出所有组织热图：
还可以下载详细数据CSV：
其他更多功能可登陆网站或查看原文：
网站链接：
https://bar.utoronto.ca/eFP-Seq_Browser/
原文链接：
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/tpj.14468- 本文固定链接: https://maimengkong.com/moreshare/899.html
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