比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的,共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。Mauve是一款非常简便高效的基因组比对工具,可以用它来画基因组共线性图。下面我们就来介绍一下使用方法。
操作步骤安装Geneious
安装Mauve插件 将基因组导入 选中要比对的序列 选择比对全基因组 默认参数,OK
等待程序运行完
结果出来了,紫色部位是重排区 放大之后的效果,可以看到基因组位点间的线性关系 再放大可看到碱基间的线性关系 可以将图片导出
导出后的效果,可用AI等修改 好了,以上就是使用mauve画基因组共线性图的操作 。如果文章对你有所帮助,请转发给你身边需要的人噢!
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- 转载请注明: : 萌小白 2023年1月12日 于 卖萌控的博客 发表
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