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2023
01-12

眼前一亮的基因组共线性图,用mauve就行

比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的,共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。Mauve是一款非常简便高效的基因组比对工具,以用它来画基因组共线性图。下面我们就来介绍一下使用方法。

操作步骤

安装Geneious

安装Mauve插件 将基因组导入 选中要比对的序列 选择比对全基因组 默认参数,OK

等待程序运行完

结果出来了,紫色部位是重排区 放大之后的效果,可以看到基因组位点间的线性关系 再放大可看到碱基间的线性关系 可以将图片导出

导出后的效果,可用AI等修改 好了,以上就是使用mauve画基因组共线性图的操作 。如果文章对你有所帮助,请转发给你身边需要的人噢!



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作者:萌小白
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