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2023
06-21

什么是 ECC 内存？

ECC 存储器或纠错码存储器是一种RAM（随机存取存储器），它利用纠错码来检测和纠正RAM 上的潜在数据损坏。与只能检测常见内存错误的非ECC RAM 相比，ECC RAM可以在内存错误导致数据损坏或事件系统崩溃之前立即检测并修复它们。这就是为什么ECC 内存被用于众多企业应用程序，尤其是任务关键型应用程序的原因。是什么导致 RAM 中的内存数据损坏？像 RA...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
06-18

MolCell单细胞测序揭示健康非酒精性脂肪性肝炎肝脏细胞通讯图谱

编者按受体配体的相互作用是复杂器官实现细胞间信息交流的途径，肝脏作为哺乳动物体内重要的器官之一，其细胞通讯网络图谱一直未被阐明，本研究将健康和非酒精性脂肪性肝炎小鼠肝脏中的非实质细胞进行单细胞测序，为健康和疾病中的肝脏细胞间通讯和重编程提供了新的见解。基本信息样本：健康和非酒精性脂肪性肝炎小鼠肝脏（n=6）方法：10x Genomics单细胞转录组测序年份：2019期刊...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
06-18

染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq）的数据挖掘思路 ｜干货系列

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。CHIP-seq研究的数据挖掘思路主要分为3步：整体把握CHIP-seq图谱特征：peak/reads在基因组上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距离TSS位点的距离分析、peak修饰基因的功能分析筛选具体差异peak和基因：差异peak鉴定、非时序数据的...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2023
06-18

单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正

01前言实际的科研项目中不可能只有一个样本，多样本的单细胞数据如何合并在一起，是否需要校正批次效应呢？先上一张图说明多样本scRNA数据的批次效应：左边的图简单地把多个单细胞的数据合并在一起，不考虑去除批次效应，样本之间有明显的分离现象。右边的图是使用算法校正批次效应，不同的样本基本融和在一起了。scRNA数据校正批次效应的算法有很多：MNN, CCA+MNN, Harmony, Scanor..... 阅 读 全 部 >
2023
06-18

使用R语言的正确姿势，R包干货奉献

来源 | R友舍先思考，后动手，能让你减少很多无谓的功夫，加快完成任务的效率。按照一定的逻辑思路来行事，更是如此，比如按照一定的通用流程在数据科学项目中使用R语言。数据导入数据整理数据可视化数据转换数据建模统计推断【下面列出每个步骤最有用的一些R包】1.数据导入以下R包主要用于数据导入和保存数据：·feather：一种快速，轻量级的文件格...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
06-18

16S从实验到数据分析最全流程

本文主要介绍了16S的实验、建库、数据分析等过程，也是我自己近期的一个小总结，初学之时从很多前辈的无私分享中受益良多，在此也和大家分享一些我的见解，当然我也只是一个初学者，还有很多不完备之处，希望能与各位一起交流分享。导航本文一共分为三个部分：实验部分建库测序16S测序数据分析一. 实验部分：DNA提取与质检1...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
06-17

【生物信息学笔记】欧洲生物信息中心（EBI）资源

我们接着讲生物信息学的资源，之前我们介绍了NCBI，欧洲也有一个非常大的centralized resource，叫EBI 。和NCBI有点类似，也是一个包含各种各样数据库这样的资源，它主要也是针对从序列到蛋白到蛋白结构到表达到通路到Ontology各个方面。首先在DNA，RNA和蛋白的方面，基因和基因组最主要是有一个ensembl，很多人不知道EBI也会知道ensemb...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2023
06-17

16S从实验到数据分析最全流程

本文主要介绍了16S的实验、建库、数据分析等过程，也是我自己近期的一个小总结，初学之时从很多前辈的无私分享中受益良多，在此也和大家分享一些我的见解，当然我也只是一个初学者，还有很多不完备之处，希望能与各位一起交流分享。导航本文一共分为三个部分：实验部分建库测序16S测序数据分析一. 实验部分：DNA提取与质检1...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
06-17

群体遗传进化必备小知识

群体遗传学是研究群体的遗传结构及其变化规律的遗传学分支学科。其应用数学和统计学方法研究群体中基因频率和基因型频率以及影响这些频率的选择效应和突变作用，研究迁移和遗传漂变等与遗传结构的关系，由此探讨进化的机制。今天小编与大家沟通学习总结一下群体进化的15个小知识。01群体：是指生活在一定空间范围内，能够相互交配并生育具有正常生殖能力后代的同种个体群。群体与个体相对，是个...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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