生信分析中我们经常会做KEGG和GO富集分析，一般拿到结果后就想到用柱状图展示pathway的富集情况。比如下面这样：如果学会使用Cytoscape中的ClueGO+CluePedia插件，可以帮我们更形象地展示pathway之间的关系，以及gene在pathway中的富集情况，论文插图瞬间提示一个档次，比如像这样：下面我们就来看一下如何使用Cytoscape中的Clue...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
作者介绍：黄升，普兰金融数据分析师，从事数据分析相关工作，擅长R语言，热爱统计和挖掘建模。目录使用Logistic和NaiveBayes建模Score Card原理Naive Bayes评分卡Logistics评分卡前言信用评分是指根据客户的信用历史资料，利用一定的信用评分模型，得到不同等级的信用分...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
投稿系统网页顶部内容，登录个人账号即可查看。以完成所有内容提交后的确认界面内容开始， Step7：Review & SubmitStep 1：view and Respond to Decision Letter 进行确认Step 2：Type, Title, & Abstract 进行确认Step 3：Attributes（定语/属性，即关键词） 进行确认S...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
这一篇很早就想写了，一直拖到现在都没写完。虽然最近的社交网络上娱乐新闻热点特别多，想用来做可视化分析的素材简直多到不可想象，但是我个人一向不追星，对明星热文和娱乐类的新闻兴趣不是很大。还是更愿意把自己的精力贡献在那些不起眼的，然而却更能触动我们心灵与文化内涵的素材上来。今天要写的主题中国的世界遗产名录，我将使用简单的网络数据抓取，多角度呈现我国当前已经拥有的世界遗产名录数目、类别、地域分布、详情介... 阅 读 全 部 >
这些使用技巧是搜罗网上的资源，根据自己的使用体验整理的，欢迎相互交流学习。一、 设置特定的Endnote引用文献输出格式不同的期刊或者会议，对于论文末引用文献的输出格式大不一样，虽然Endnote中大量的Style供你选择，但有时总是或多或少跟目标期刊的Style有些区别。能找到一样的Style最好，不能找到的话就编辑与目标期刊Style相似的Style进行编辑。其步骤如下：1...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
Linux 中经常看到利用 crontab 留后门，从接触的样本看多利用方式多是:① 是直接利用 crontab 命令；② 直接修改/etc/crontab。不论是样本，还是博客对其它方式讨论较少。本文主要讨论：① 计划任务有哪些类别；② 直接修改数据文件方式创建计划任务及其中的关键点；li...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
一、Crontab查看编辑重启1、查看crontab定时执行任务列表crontab -l2、编辑crontab定时执行任务crontab -e3、删除crontab定时任务crontab -r4、相关命令：sudo service crond start #启动服务sudo service crond ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
Linux系统是生物信息分析中需要用到的系统，我们可以在服务器上或者个人电脑上安装Linux系统，从而使用生物信息软件进行生物信息数据分析，下面我们一步步的开始进行Linux系统的安装。安装步骤：准备一个U盘，电脑插上U盘，打开UltraISO软件，文件---打开，选择你下载好的CentOS-6.5-x86_64-bin-DVD1文件，点启动光盘--写入硬盘镜像，在硬盘驱动器里面选择你的...阅读... 阅 读 全 部 >
RSeQC是一个RNA-Seq质控工具，提供了一系列有用的小工具能够评估高通量测序。其中一些基本模块：检查序列质量、核酸组分偏性、PCR偏性、GC含量偏性，还有RNA-seq特异性模块：评估测序饱和度、映射读数分布、覆盖均匀性、链特异性、转录水平RNA完整性等。下面我们就来介绍一下RSeQC的使用方法：#安装RSeQCtar zxf /opt/biosoft/RSeQC-2.6.4.tar.gz.... 阅 读 全 部 >
主要介绍Linux进程相关知识 及部分命令参考1.概述Linux是一个多用户、多任务的系统，能同时运行多个程序，从而产生多个进程。Linux进程中，进程和线程没有什么区别。Linux中的进程是一个数据结构，如下：struct task_struct { // 进程状态 long state; // 虚拟内存结构体 struct mm_struct *mm; // 进程...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >