非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）是一种独特的RNA转录本，占人类基因组RNA的90%以上，除少数具有开放阅读框，因而具有编码潜能以外，通常不编码蛋白质，而是作为发育、增殖、转录、转录后修饰、凋亡、细胞代谢等多种生物过程的重要调控因子。广义上讲，转运 RNA ，核糖体 RNA ，核内小分子 RNA 及核酶等都属于非编码 RNA, 对于这些非编码 RNA 的结构和功能，人们已经有了较为深入的认识。
ncRNA的种类主要包括微小RNA（microRNA, miRNA）、小干扰RNA（small interfering RNA, siRNA）、PIWI-interacting RNA（piRNA）、转运RNA衍生小RNA（tRNA-derived small RNA, tsRNA）、核小RNA（small nuclear RNA, snRNA）、核仁小RNA（small nucleolar RNA, snoRNA）、长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）、环状RNA （circular RNA, circRNA）、假基因等，其中，miRNA、lncRNA、circRNA均有参与先天免疫的调节。
1、微小RNA（microRNA, miRNA）
miRNA是短ncRNA，约为22～23个核苷酸，其编码基因由RNA多聚酶Ⅱ转录，通过与mRNA 3′端非翻译区（3′ untranslated region, 3′UTR）之间的结合调控mRNA的表达，超过60%的编码基因是miRNA的潜在调控靶点。
2、长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）
lncRNA是长度超过200个核苷酸的非编码RNA，其生物发生过程与mRNA类似。lncRNA在细胞周期调节、染色质修饰、mRNA翻译等多种生物过程中发挥重要作用。
3、环状RNA （circular RNA, circRNA）
circRNA属于lncRNA，主要由外显子或者内含子序列产生，是一种单链环状RNA分子，可以作为竞争性内源性RNA与miRNA结合，调节转录或影响亲本基因表达。
4、PIWI-interacting RNA（piRNA）
piRNA是一种长度约为21～35个核苷酸的小RNA，由长单链转录本加工而成，这些转录本的基因组位点聚集在整个基因组中，并由RNA多聚酶Ⅱ转录。 人类基因组中大约有20 000个piRNA，主要表达于性腺细胞。
5、转运RNA衍生小RNA（tRNA-derived small RNA, tsRNA）
tsRNA来源于核酸酶对tRNA的酶切，通常长度为18～40个核苷酸，在调节翻译、维持mRNA的稳定性、基因沉默、逆转录等过程中发挥重要作用。
非编码RNA的生物合成
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